El FOSEP cuenta con su Ley Orgánica que le proporciona el marco normativo, definiendo su naturaleza jurídica de corporación financiera de fomento al desarrollo económico y social, mediante la concesión de créditos o donaciones para cubrir los costos de los estudios y actividades de preinversión que requieren los usuarios (inversionistas).

Para normar y regular sus operaciones el FOSEP cuenta con su Reglamento General, Manuales, Guías e Instructivos, Formatos, su Registro Nacional de Consultores, etc.; así como instrumentos legales y administrativos derivados de los préstamos o donaciones que recibe de Organismos Financieros Internacionales.